Le 8 février 2021, le mandataire du Collectif contre l'islamophobie en France, Maître Stefen Guez Guez, a annoncé que l'association portait plainte contre la Ministre déléguée en charge de la Citoyenneté Marlène Schiappa, pour des propos que cette dernière a tenu sur BFM TV la veille.
Selon le communiqué, Marlène Schiappa a affirmé que le CCIF avait lancé des «appels à la violence ou à la haine vis-à-vis de telle ou telle personne», et faisait partie des organisations qui «ouvertement lancent des appels à l'apologie du terrorisme, à la haine de l'autre ; tiennent des propos antisémites».
Après avoir rappelé que le CCIF n'a «jamais été condamné (ni même poursuivi) pour aucune de ces graves accusations», le communiqué déclare que le fait de porter ces accusations à l'encontre de l' «association (même dissoute) constitue une diffamation».
Le 2 décembre dernier, le gouvernement avait en effet dissous en Conseil des ministres le CCIF, ce dernier étant accusé de faire de la «propagande islamiste».