Une résidente du quartier, Minako Akiyama, a déclaré à AP qu’elle a d'abord entendu un bruit assourdissant, «comme si quelque chose était déchiqueté».
«Il y a eu un grand Boom ! Je me suis précipitée à l’étage et, là, j’ai vu que la maison en contrebas était en feu, avec la queue d’un avion qui sortait de celle-ci», a-t-elle dit.
Sur les cinq personnes à bord de l’avion, deux sont décédées.
Une autre victime, une femme, a été tuée dans l'une des maisons, tandis que deux autres personnes ont été blessées.
Parmi les victimes tuées figurent le pilote de l’appareil, âgé de 36 ans, ainsi qu’un employé de SIP Aviation, une société de formation au pilotage d’avion privés de petite taille.
Dans la matinée, le Service des incendies de Tokyo a tweeté qu'il combattait les flammes et tentait de retrouver d’éventuelles victimes dans «chaleur intense».
L'avion volait en direction de l’île d’Izu Oshima, à environ 100 kilomètres au sud de Tokyo dans l'océan Pacifique, selon la radio locale NHK.
Les policiers enquêtent actuellement sur les causes de l'accident.